เพื่อให้การดำเนินการสร้างความเข้มแข็งของระบบคุณธรรมและคุ้มครองความเป็นธรรมในระบบข้าราชการของ ก.พ.ค. เป็นที่ยอมรับของข้าราชการพลเรือน  ก.พ.ค. จึงวางแผนยุทธศาสตร์และกลยุทธ์ไว้  ดังนี้

ยุทธศาสตร์  ปี 2552 – 2553

• ก.พ.ค. เป็นที่รู้จักและมีผลงานรองรับที่เด่นชัด

  • กลยุทธ์เสริมสร้างประสิทธิภาพการดำเนินงานของ ก.พ.ค.

  • กลยุทธ์การเสริมสร้างองค์ความรู้ความเข้าใจเกี่ยวกับก.พ.ค.

  • กลยุทธ์การสร้างเครือข่ายการพิทักษ์ระบบคุณธรรมเชิงสร้างสรรค์

ยุทธศาสตร์  ปี 2554 – 2555

• การสร้างผลงานให้เป็นที่ยอมรับ

  • กลยุทธ์พัฒนาเพื่อเสริมสร้างความเข้มแข็ง และให้ ก.พ.ค. เป็นที่ยอมรับ

  • กลยุทธ์การเสริมสร้างองค์ความรู้และพัฒนานวัตกรรมการพิทักษ์ระบบคุณธรรม

  • กลยุทธ์ขยายเครือข่ายและหุ้นส่วนการพิทักษ์ระบบคุณธรรม

ยุทธศาสตร์  ปี 2556 – 2557  

• สร้างวัฒนธรรมยึดมั่นระบบคุณธรรมในการบริหารราชการ และ ก.พ.ค. ได้รับการเชื่อมั่นเป็นองค์กรหลักในการพิทักษ์ระบบคุณธรรม

  • กลยุทธ์การพัฒนาและเพิ่มพูนประสิทธิภาพการดำเนินงานของ ก.พ.ค.

  • กลยุทธ์เสริมสร้างการยอมรับและเชื่อมั่นต่อ ก.พ.ค. เป็นองค์กรหลักในการพิทักษ์ระบบคุณธรรม

  • กลยุทธ์พัฒนาและวางระบบเปลี่ยนผ่านการพิทักษ์ระบบคุณธรรมจากชุดแรกสู่ชุดต่อไป